秦始皇与成吉思汗是两种不同的帝王，站在历史的长河之中看，秦始皇比成吉思汗厉害得多。成吉思汗曾经遗憾的说，没有跟岳飞同代而生，否则他就可以跟岳飞一较高低了，作为草原的英雄成吉思汗是孤单的。在铁木真的年代，无数英雄死于铁木真之手，他西击欧蛮，北击俄夷，南伐金蛮，东征朝鲜，一直都是无敌的存在。不过铁木真要是生在秦始皇时代，他就要恨“既生铁木真，何生嬴政”了。
秦始皇时代，华夏文武并重，特别是武风盛行，凡有血性，皆有争心。百姓勇于公战，怯于私斗，闻战而喜，看书则烦；当时秦军武功赫赫，南征北战，西征东讨，实为百战之师，能战之军。秦始皇手下谋臣如云，名将成林，秦始皇又善于用人，人才都在秦始皇手下能建功立业，且无性命之患。要击败铁木真，遣蒙恬领三十万秦军深入蒙古草原就可以了，铁木真虽然军事才华过人，但是要战胜蒙恬难，以十万匈奴勇士对战三十万秦军，胜算小。就算铁木真跟蒙恬打成了平手，秦始皇可以将战神王翦派出，以王翦的老道成稳，击败铁木真易也。
而如果仅凭个人打仗能力的话，成吉思汗应强于秦始皇。毕竟成吉思汗及其子孙开疆扩土之广，世所罕见。而另一方面秦始皇基本上是继承祖业，是秦国几代君主的努力，到秦始皇时厚积薄发的结果。
因此，个人功绩影响势力扩张这方面的话，成吉思汗当强于秦始皇。但是，这差不多也是成吉思汗唯一强于秦始皇之处了，在文化影响、对后世的遗产、以及积极性方面，成吉思汗完全不能与秦始皇相提并论，差距太过悬殊。
总的来说，秦始皇和成吉思汗都是古代杰出的君主，二人成长的历史条件也完全不一样，但是对历史的贡献，还是秦始皇更厉害，无愧于千古一帝。当然，除了历史功绩，无论秦始皇还是成吉思汗，对历史文化的破坏也是很厉害的，比如秦始皇焚书坑儒，成吉思汗圈田为牧，这些方面两人基本上可以说是伯仲之间，难辞其咎。